《太空巨人》的游戏世界与《战锤4000》有共通之处，《太空巨人》设定于《战锤40000》的宇宙中，而太空巨人是对那些在亚空间（Warp）中迷失的船舰或其他物体的总称，当船舰要星际旅行时，透过穿梭亚空间可以让船舰在短时间内就行过广大的宇宙，到达目的地。然而这种旅行有相当的危险性，亚空间中充满风暴与各种怪物，一艘船的船员被上述以及其他危险消灭掉的事件实在不是少数。这样一艘失去船员的船就这样在亚空间里飘流数个世纪。然而偶尔亚空间会和现实世界相触，产生亚空间风暴，亚空间的鬼船会被拉到该处，撞在一起。这样数艘船混起来的物体就是太空巨人，有些太空巨人很小，只包含了两三艘船舰，其他的可能很大，体积高达数百立方公里。当这些荒舟出现在现实世界时，他们就有可能成为基因窃取者的窝。另外，太空巨人可能包含了珍贵的货物，例如透过失落的科技制造的物品，这一次，对抗那些外星盗窃者的战斗又一次打响，主角们又一次要为了生存而战了。